Непонятно, что конкретно интересует!
Flask ничем не отличается от других Python фреймворков. Если использовать связку Flask + SQLAlchemy + WTForms, то это считай тот же Django, только без contrib и админки. Изначально нужно быть готовым к самостоятельному созданию организации структуры проекта, т.е. где конфиги положить, где модели, где тесты и т.д. Есть несколько проектов-заготовок, которые это упрощают.
Несколько ссылок по теме:
github.com/mitsuhiko/flask/wiki/Large-app-how-to
github.com/swaroopch/flask-boilerplate
github.com/semirook/flask-kit
github.com/imlucas/flask-tool
github.com/klen/Flask-Foundation
У Flask сейчас довольно много расширений, проверенные лежать тут
flask.pocoo.org/extensions/. Много других можно найти тут
crate.io/?has_releases=on&q=flask. Рекомендуется конечно учитывать что некоторые могут быть криво написаны или морально устарели.
По устройству проектов еще можно поискать готовые приложения. Они есть тут
flask.pocoo.org/community/poweredby/, те, которые с исходниками. Еще на гитхабе много чего, можно поискать по импортам, где используется Flask, в простейшем случае так как-то
github.com/search?l=Python&q=from+flask&ref=searchresults&type=Repositories.