В целом все делается iptables, в нем можно настроить дроп случайных пакетов, что очень хорошо эмулирует обрывы на канале, так же настраивается с помощью tc лимиты скорости с burst. В nginx есть лимиты запросов с burst может тоже будут интересны.
У вас два одинаковых локейшена, включите здравый смысл, знания тут не нужны, перенесите папку с phpmyadmin в директорию сайта если не умеете вариать nginx.
Один только вопрос зачем людям работать под администратором?
Настраиваете групповые политики в домене и проблема с левым софтом решается раз и навсегда.
Ну у каждого клиента свое соединение по тисипи в него и слать данные клиенту, какие то странные у вас вопросы, может вам почитать матчасть?
В винде по мойму сокеты образуются для соединения с клиентом.
Если есть деньги то можно заюзать growndwork он тот же нагионс тока с поддержкой и кучей плюшек, мониторит смарты, температуры, нагрузки, рейды и многое другое, для всех систем, гибкая настройка рассылки оповещений.