вот вам готовая команда, что не синкать подправьте под себя
rsync -xrlptgoEv --progress -e ssh --exclude-from=/root/exclude.txt root@213.133.111.169:/ /
Дмитрий Калинин: бд надо
Остальное зависит от приложения
Какой бекап?
Нет тут никакого бекапа
Просто миграция здесь и сейчас
О каких конфликтах может идти речь когда у вас чистая машина и никаких служб и чего то ещё не запущено