А что тут думать?
Вы выполняете кроном команду root, на этом оно и валится. (Хотя, да есть такой вариант вызова, однако не знал о нем)
Если вам нужно запустить приложение от root, положите его в cron root пользователя или выполняйте su/sudo.
Для большого количества cron задач особенно для питонистов, коим, судя по всему, вы являетесь сейчас модно использовать airflow.