Управлять зарядом акб должен контроллер, он заряжает батарею пока напряжение на акб не достигнет определенного предела, так что лучше заморочаться и купить аккумулятор с контроллером.
Плата коптера нагрелась скорей всего от большего тока при зарядке акб.
