Назар Мокринский

1) Каким кабелем/интерфейсом подключен монитор?
2) Какая версия Ubuntu используется?
3) Какая видеокарта установлена?

В общем и целом упомянутый пост датируется 2013 годом, многое изменилось с того времени, ни разу не помню чтобы нужно было вручную что-то делать с настройкой монитора, обычно само всё работает как положено.

А в чём проблема-то? Где именно кириллица не отображается?

Я бы арендовал где-то рядом относительно дешевый сервер с более широким каналом и фильтровал бы трафик там, а до целевого сервера проксировал бы только отфильтрованный трафик.
Если не хватает вычислительных мощностей - один сервер впереди что проксирует трафик на 2 поменьше, и уже те занимаются фильтрацией.

А вообще лучше обратиться к услугам компаний что занимаются предоставлением подобной защиты с последующим перенаправлением трафика на ваш сервер, это будет надежнее и дешевле.

apt-get install php5-gd
Это работает на чистой Ubuntu 14.04 после apt-get update
Приведите содержимое /etc/apt/sources.list и если есть что в /etc/apt/sources.list.d - то для начала список файлов из этой директории.

1) Убедитесь, что designer имеет доступ не только к /var/www/project/public, но и ко всем родительским директориям
2) Вам не нужен chroot, с ним вам нужно будет внутрь chroot положить все необходимые бинарники вроде /bin/bash, иначе оболочка не запустится, из chroot же доступа к ним нет; просто настройте права и ограничьте оболочку нужными командами в зависимости от потребностей

Ещё есть вариант с OverlayFS и альтернативами (если старое ядро) если вам не нужно менять существующие файлы (или по крайней мере большинство из них). Будет два слоя файловой системы - часть read-only на нижнем, и верхний ля записи. Файлы на нижнем слое можно, на сколько знаю, менять, но изменения будут храниться на верхнем слое.

В хостовой системе ТОЛЬКО штатный пакетный менеджер, в Docker контейнерах внутри можно что угодно, если контейнеры шаблонные. Если же предполагается обновление внутри контейнера - только исключительно системный пакетный менеджер. В крайнем случае хоть как-то создать пакет самостоятельно, чтобы его можно было при необходимости чистенько удалить.

Рекомендую брать Docker, оформлять в docker-compose.yml, и запускать через Docker Compose.
Если нужно будет сменить версию PHP - просто меняете версию в yaml файле и docker-compose up -d, всё перезапустится с нужными версиями. Для графического управления БД есть PhpMyAdmin, опять таки, в виде контейнера - подключайте куда нужно. В hosts придется ручками добавлять, но у меня как-то с этим проблем не было, весьма редко новые сайты в разработку добавляю.
Можно так же ярлычки на любые команды сделать, в том числе на автоматическое заполнение hosts. Всё достаточно просто, но по большей части самостоятельно (как-то даже не интересовался, есть ли что-то графическое, да и одной версии PHP мне хватает).

Первый установлен через пакетный менеджер. Удалить можно так: sudo apt-get purge node-typescript.
Второй был установлен через NPM. Удалить можно так: sudo npm uninstall -g typescript.

Какой вам нужен - тот оставьте, второй удалите.

В вашем случае нужен модуль php7.0-sqlite3 из того же репозитория