Тут много нюансов и ответить однозначно сложно. Как уже написал Иван Шумов фреймворк - это инструмент. Каждый инструмент подбирается под конкретную задачу:

• СMS - система управления сайтом (Wordpress, Joomla и т.д.). Создан для простого и удобного управления сайтом (контентом). Как правило, доступен для работы простому пользователю, без знания языков программирования. Подойдёт для: простых сайтов, блогов, там где не требуется нагрузка и безопасность.
  
• RAD framework (Yii2) - фреймворк для быстрой разработки. RAD Фреймворк имеет, монолитную и связанную архитектуру. Он является антипаттенрном и позволяет вам делать всё что угодно, лишь бы вы быстро собрали свой проект. (Используется паттерн Table First - спроектировали базу и по схеме сгенерировали модели данных). При этом Вам никто не говорит, что он не может использоваться для серьёзных проектов. Например, DNS..
  
• Компонентные фреймворки (Symfony, Laravel). Это фреймворки, которые разделены на независимые компоненты, которые вы можете подключать к своему проекту при необходимости. В самом фреймворке заложен только необходимый минимум, а всё остальное вынесено в компоненты. Эти компоненты могут использоваться (или не использоваться). Могут использоваться для другого фреймворка (сам Yii2 использует компоненты симфони). Doctirine, которая позволяет вам забыть о базе данных и сосредоточиться на коде. Фреймворк задаёт вам некий стиль, некую структуру и типизацию и требует более хорошего и обдуманного кодинга. Например, при использовании twig вы не сможете сделать запрос в view. Чего нельзя сказать про Yii. Вы там можете построить хорошую бизнес логику, что и встречается...
  
• Микрофреймворки (Slim). В таких фреймворках заложен самый минимум, а всё остальное программист должен искать или писать самостоятельно, выстраивать свою архитектуру приложения. Он легкий и простой. Кто-то и Symfony относит к микрофреймворкам. Тут меня многие могут упрекнуть. Подойдет для очень простых, гибких, легких приложений, например, микросервисов. Фреймворк не задает вам никаких правил и архитектуры. Вы должны сами продумать все детали приложения. Где-то используете twig, где то Data Mapper, где-то ActiveRecord. Для работы с таким фреймворком требуется много знаний и опыта. Так как вам всё придется делать самому. Здесь за вас никто не подумал.
  

Что же для чего выбрать?
Решать вам исходя из конкретной задачи. Здесь нет понятия хуже/лучше. Чтобы что-то выбрать нужно на каждом попробовать собрать пару проектов. Тогда и будет понимание когда и что выбирать. Это как автомобиль. Какой лучше BMW или LADA? Оба автомобиля, но каждый для своей аудитории, по своим потребностям, для своих задач.

Почему другие говорят что Yii2 плохой?

• 2 версия морально устарела. Это не значит что ВЕСЬ фреймворк плохой, просто им давно никто не занимался. Сейчас идет разработка Yii3, которая многократно лучше 2 версии, но 3 версия доступна только в демо. Поэтому, если хочется писать НОВЫЙ проект на Yii, то я бы не стал выбирать 2 версию. Можете подождать Yii3, но никто не знает когда будет релиз. Можете начать писать используя Yii3-demo, но там может всё поменяться к моменту релиза.
  
• Он монолитный. Если вам требуется сделать проект используя много приложений с разными компонентами, то пойдёте по пути Advanced шаблона, где каждое приложение будет папкой: backend, forntend, console. Однако при большой нагрузке вам потребуется разносить приложения. Тогда ваш core будет дублироваться во всех приложениях. Там будет то, что вам даже не требуется. Потому что Yii2 монолит.
  
• В Yii2 используется Actvie Record. AR - это не плохо. Его многие любят, многие ценят и хвалят. Но для больших проектов он предоставляет неудобства. Например, при изменении поля в базе данных - приходится менять все свойства и надеяться что везде поменяли, так как в GrigView используется магия, при получение значений из модели 'value' => 'profile.last_name'. Так же нельзя сделать свойства модели (сущности), приватными. Из-за чего состояние модели можно изменить где угодно и вы никак не проконтролируете это.
  
• Много абстракции, которую не распознает редактор. Например, вы можете вызвать в контроллере Yii::$app->user->id. Вам приходится делать докблок, что User это common/auth/Identity, а не yii/web/User
  

Ну и так далее. С каждым из этих пунктов можно бороться, при правильном подходе. Как уже сказали в плохих руках любой код может пахнуть. Но это основное. Надеюсь, меня не раскритикуют другие за спорные моменты. В таких вопросах всегда есть разногласия) Думаю, что смог донести в сжатом виде отличия.

Всё, кроме того что советуют учить по теме: «Что учить новичку в 2020?»

Очень сложных проектов на Yii2 с открытым, да ещё и хорошим кодом очень мало)) Прежде всего, потому что Yii создан для быстрой разработки нарушая все правила сложных архитектур. А учитывая его устарелость, то тем более таких проектов мало. На форуме давно обсуждался этот вопрос. Там есть ссылки на проекты и код. Так же на сайте yiipowered.com есть список проектов, у некоторых с исходным кодом.

Вам лучше изменить тактику и искать проекты с хорошей архитектурой вне зависимости от фреймворка. Так ваша вероятность найти что-то стоящее на много выше. В целом, хорошая архитектура - это всегда дорого. Мало кто будет выкладывать проект большой команды, на которую были потрачены сотни тысяч и миллионы в открытый доступ. Кроме того хорошая архитектура всегда зависит от требований, задач и самого проекта. Что и где применять, как строить - придет только со знанием и опытом. Здесь не получится сделать по примеру.

Если по теме, то начните изучать или искать DDD, CQRS, SOA, Микросервисы. В принципе это основные архитектурные подходы в разработке. На Yii по DDD есть хороший пример. Однако начинать НОВЫЙ проект на Yii2 используя даже самую сложную архитектуру - путь в никуда. Yii2 создан для других целей. Чтобы понять можно посмотреть ответ на вопрос: Актуален ли Yii2 Фреймворк в 2020?

По этому вопросу очень долго искал ответа))
Вам уже скинули статью по независимым модулям, но этого мало. Что вам нужно:

1. Независимый слой MODEL.
В этой папке находятся Use Case (Service), Сама сущность Entity (AR), Желательно иметь репозитории для изоляции от базы данных ну и другой доменный слой логики, который не зависит ни от чего. Ни от фреймворка, ни от других модулей и пакетов. Ваша задача написать код в этой части так, чтобы его можно было скопировать в любую папку, настроить зависимости и чтобы этот код заработал хоть на чистом PHP. Если не планируете менять фреймворк, то можно зависить от фреймворка.

2. Зависимости
Все зависимости модуля реализовать либо через Interface либо через события, но события лучше. А дальше уже синхронизируйте через приложение или отдельный модуль. Можно и по api.

3. UI (пользовательский интерфейс)
Он может быть зависимым от других модулей. В него входят: контроллеры, view, формы, vue.js и так далее. В общем то, с чем взаимодействует пользователь.

Тем самым получается такая система если опираться на MVC:
VC - могут быть зависимы от других модулей
M - не может быть зависима ни от чего, кроме PHP. Желательно и отделять слой базы данных с помощью Repository. Тогда ваш пакет будет очень сильно независим даже от базы. И вам вообще будет без разницы куда вы это храните в user или employee.

Если будет такой слой, то можно спокойно переносить хоть на будущий Yii3. Однако На Yii1 и Yii2 такое сделать сложно. Надо изворачиваться и займет это больше времени. Так как сам Фреймворк вставляет нам палки и приходится делать костыли из-за его монолитности. К такому подходу не привыкли Yii1 и Yii2 разработчики. Обычно на Yii такое понимание «фигак, фигак и в продакшн».

Такую архитектуру удобно будет строить на Symfony ну и будущем Yii3.

Рекомендую к прочтению:

• Мастер-класс Интернет-магазин на Yii2
  
• Создание архитектуры программы или как проектирова...
  
• https://www.yiiframework.ru/forum/viewtopic.php?f=...
  
• https://habr.com/ru/post/329286/