Врёт ваша VestaCP. Показаны одинаковые значения для обоих демонов.
Не может Spamassassin столько выедать. MySQL может, но данные, похоже, тоже неверные. Посмотрите из консоли ps или top.
MyISAM можно переносить простым копированием файлов баз данных, в InnoDB нет. Для последнего следует использовать штатные средства mysqldump для снятия копии и последующего восстановления mysql.
В MySQL есть встроенный шедуллер или events. Можете для каждого такого события создавать разовый event с удалением нужного, либо сделать единый который будет проделывать то же для всей базы с определёнными интервалами.
