Как в Roundcube работать со спамом?

При грамотной настройке всё работает

Как сделать почтовый сервер на несколько доменов?

На самоподписаный клиенты будут ругаться при подключении, что может напугать пользователей.

Как отслеживать forward писем в Email-рассылках?

По конкретным адресам маловероятно. Вообще, глобально задача не решаема на сей момент.

Как отслеживать forward писем в Email-рассылках?

DMARC настраивается для домена. Подробнее о том, какую информацию можно получить из отчётов см. dmarc.org
Форвардинг там виден.

Как исправить проблему с репозиториями pkgng во FreeBSD 9.2?

У меня вот так
root@beta:/usr/local/etc/pkg/repos # cat FreeBSD.conf
FreeBSD: {
url: "pkg+http://pkg.FreeBSD.org/${ABI}/latest",
mirror_type: "srv",
enabled: yes
}

Нужно ли волноваться по поводу указания пароля в php-файле?

Поддержу. Файлы конфигурации это стандартная практика.

Есть аналоги Wordpress но попроще?

+100500. Тоже рекомендую.