Я читал, что 2 SBS могут жить вместе неделю. В целях миграции. Скорей всего так и придется делать. Добавить SBS. Перенести на него FSMO. Снести старый и заново его собрать.
Но. Даже имея WS2003 x86 ent. edition с включенныеми /PAE не все приложения смогут поддерживать расширенную адресацию. И также будут иметь в максимуме своем 3gb памяти (c /3GB в boot.ini)
Смотря с какой стороны смотреть. Если у Вас стоит Quad-Core с 16Gb и все это на Windows Server 2003, которая по определению x86, то исходя из архитектуры, доступной памяти будет только 4Gb.