Если действительно наблюдается совершенно нехарактерный звук от работы hdd, экспериментально проверьте Вашу теорию, установите другие ОС и оцените результат. Продолжая исключать варианты, можно проверить эти диски установив их на другой сервер или компьютер, в этом случае должен использоваться другой контроллер дисков. Например, был случай с HP, заменили диск в RAID массиве на достаточно старом сервере > 5 лет, диск быстро сломался, совершенно нехарактерным образом, начала разрушаться поверхность. Потом все повторилось с другими новыми дисками. Выяснилось, что firmware нового диска требует более новой прошивки RAID контроллера, обновили и все заработало как нужно.
Если на других ОС диски будут работать по другому, то можно попробовать в Астре выбрать файловую систему xfs вместо ext4.
Если данные методы не помогут, то скорее всего это особенность этих жестких дисков, можно обратиться с вопросом к вендору, так как скорее всего диски новые и на них есть гарантия.