Извиниться, отказаться, вернуть деньги.
Если сделанная работа действительно хороша, то закончить и продать как «сборку» или «свой плагин», что бы окупить затраты, отобьетесь как минимум.
Вы настолько промахнулись с оценкой работы УЖЕ, что продолжать ее дальше — делать себе же хуже.
Заказчик опять же после сроков пропущенных в 3 раза будет ожидать явно большего.
Вы потратив кучу времени поэтому тоже явно уже не будете довольны проектом и радость от завершения не будет полной.
p.s.: Без обид, но что можно было в жумловском виртуамарте наработать на 40 тысяч? За 40 тысяч можно свой магазин не хуже виртуамарта написать…