Любая современная ОС старается занимать всю свободную память дисковым кешем, поэтому будь у вас 64ГБ, все равно настал бы момент когда дисковый кеш съел бы ее всю. И это нормально. Вы лучше запишите видос, так легче оценить и понять причину тормозов.
Такое может случаться если уставновленный SSD не поддерживается системой. Возможно магазин вам поставил больший по размеру SSD. В любом случае нужно нести и менять.
Конечно же лучше HFS+, но если планируете использовать совместно с Win/Lin, то лучше обратить свое внимание на exFAT. Я так делаю как с флешками, так и с большими винтами. Но следует помнить, что exFAT не журналируемая ФС.
Python и Ruby. Начиная с OS X 10.7, Java не ставится по умолчанию. Но проще всего это делать с помощью OpenSSL. openssl enc -aes-128-cbc -salt -in file.txt -out file.enc — шифруем; openssl enc -d -aes-128-cbc -in file.enc -out file.txt — расшифровываем.