Потому что вы неправильно готовите :) У каждого разработчика должен быть свой репозиторий. И там он может коммитить сколько душе угодно, а вы оттуда будете вытаскавать нужные коммиты и сливать с основной веткой.

Хотелось бы раширить преидущий коммент:

1.5) делаешь dd ОБОИХ дисков куда-нибудь в безопасное место.
1.6) Пробуешь смонтировать образы, как обыные разделы. Если у тебя там просто файловые системы, то как обычно, если LVM, то надо погуглить
1.7) Пробуешь скопировать информацию

Я делаю так:

ESCDIR=$(echo "$DIR" |sed -e "s,\([]\(\).^\*\$\/&[]\),\\\\\1,g")

scp -p $DIR/.lastsync $HOST:$DIR

ssh $HOST find  $DIR/$SUBDIR  -newer $DIR/.lastsync | sed -e "s/$ESCDIR\///" | \
rsync  --exclude-from=- --delete -av $DIR/$SUBDIR $HOST:$DIR

rsync  --delete -av $HOST:$DIR/$SUBDIR $DIR 
rsync  --delete -av  $DIR/$SUBDIR $HOST:$DIR

DATE=`date`
echo "$DATE Syncing finished"
echo "====================================================="
echo "  "

touch $DIR/.lastsync

Предполагает, что во во время синка файлы не изменяются и синк не прервётся. Последнее легко исправить, а вот первое без локальной db сделать невозможно.