Может, объединить сервера в сеть посредством VPN? VPN слушает на том порту, который прописан в конфиге. Какой траффик пускать через VPN можно настроить файрволлом (например, iptables). А можно пустить через VPN весь траффик. Для того, чтобы объединить сервера в VPN-сеть, нужно выбрать, какой из серверов будет «центральным» — сервером VPN. Пусть он выдаёт остальным сертификаты.