Gora

SoftEther VPN - есть и под win кого сильно интересует этот вопрос. Так же можно настраивать предустановленным клиентов под win, ставя галочки и не ковыряя ничего в голом CLI. В работе использует 443 порт.

В свое время очень помог SoftEther VPN когда провайдер стал блокировать gre трафик.

Вряд ли Вам поможет свой DNS сервер. Для своего DNS сервера нужен прежде всего домен, VPS c установленной ОС и по классике 2 ns`a. Если все это дело размещать за бугром, то не факт что выданный Вам IP не будет уже в блоке адресов у РКН. Сам с этим столкнулся, опять же не факт что Ваш DNS, если он будет чистым, не внесут в блок! Потратите какое то время на настройку всего, чуть наличности и потом одни расстройства(возможно). Тут другое решение нужно, правильно пишут как вариант dns-proxy...

trafshow
iftop
tcpdump
В любом случае индивилуальность нужно писать самому на основе готовых утилит. А потом все это можно загнать в zabbix в графику. Готовый продукт, прямо под свои запросы вряд ли найдете.

Что то Вы намудрили в плане структуры организации сервисов, или не корректно поставили вопрос, зачем для того что требуется виртуальные машины. И DNS и Web сервер и многое другое вполне себе организуется на одном белом IP и одном VDS, без каких либо дополнений. Если конечное Вы не планируете по какой то причине изоляцию.
Для полноценного DNS сервера Вам нужны в реальности 2 DNS slave на которых будет дублироваться Ваша зона - классика жанра!

Интересно, почему никто не прошелся по Bacula. Слегка мудреный конфиг, но если все заточить под свои нужды, вещь весьма достойная. Так же легковесный rdiff-backup, ну и правильно пишут выше сам rsync. При наличии желания, времени можно написать на его основе вагон и тележку скриптов по резервированию системы.