im_dimas, пиши для себя, но в коммерческих проектах такое использовать нельзя, подумай от тех программистах кому придется поддерживать твои поделки, они же могут и найти тебя :).
Если я правильно понял, то вы для каждого шаблона создаете свою папку и копируете туда готовый header и footer, css, js. Это же бред, так не нужно делать, если в будущем вам будет нужно что то изменить, то снова придется все по 100500 раз копировать и перемещать.