Трек упрощается в 50 раз без заметных изменений и никаких 5000 точек там не нужно. Да и скриншот то чем не подходит.
Впрочем для этого требуется коммерческая лицензия. Вы же не для себя отчёт готовите.
Если вам просто определить попадания в полигон, то простите, зачем тут вообще яндекс нужен?
Яндекс в бесплатной версии запрещает диспетчерезацию, т.е. отслеживание объектов.
Во-первых вы всегда можете посмотреть "как они это реализовали", это же доступный всем желающим js-код. Я уже молчу, для ленивых, глянуть уходящие запросы.
Во-вторых, кто вам мешает фильтровать полученные данные от "проскакивают другие города".
