По моему мнению, прототип - очень важная вещь в процессе создания продукта. Проектирование - это первый этап в работе. Часто заказчик не может сказать что будет на странице сайта, например, но он знает какую задачу он должен выполнять. На основании этого создаются первые прототипы, которые обязательно потом правятся. Такие приготовления в дальнейшем сэкономят вам кучу времени и нервов. Быстро можно сделать набросок в Balsamiq.
Так же, надо различать понятия ПРОТОТИП, ВАЙРФРЕЙМ и МОКАП. Вот хорошая статья
https://habrahabr.ru/post/170549/