У вас ошибка в рассуждениях, токи одноимённых зарядов не могут течь в противоположных направлениях. В схеме, что у у вас нарисованы вы используете идеальные источники с нулевым R внутренним, в реальности будет примерно вот так:
1) Источник с б0льшим ЭДС будет гнать ток через источник с меньшим ЭДС, так заряжают аккумуляторы, например.
2) Ток через реальную батарейку будет ограничен R внутр источника.
Вот тут можете сами поиграть с параметрами схемы:
https://tinyurl.com/25oh8k9l