Кир aka Dober

В Android (до Marshmallow) нет API для мультисим.
Поэтому, реализация (как способ, так и сама возможность) зависит от вендора.
Хотя, способы реализации грубо можно разделить на группу MTK и Qualcomm

Если это именно NFC, а не, например Proximity, то технически можно. Т.к. это пропуск, то подозреваю, там Mifare Ultralight. Хотя, не обязательно.
Нужный UID, конечно, можно будет воспроизвести, но еще нужны ключи. Есть два пути:
1. Взять ключи у администратора системы контроля доступа. По сути, будет даже не эмуляция уже существующего пропуска, а генерация нового, но записанного не на пластик, а в память смартфонаю
2. Изучать вопрос с реализацией конкретной СКД индивидуально. Шансы на успешный взлом - не нулевые, но недостаточные для практического применения

"Сток" от Гугль Вы не найдете - по простой причине - Нексусов не было на этом процессоре. Этот процессор вообще любимец китайфирм, выпускающих подделки и очень дешевые телефоны.
Но, собрать AOSP под Вашу платформу может быть возможно.
Вот, у людей почти получилось, единственное, что они пока не смогли - это справится с драйверами камер. Больше базовой информации о портировании прошивок под продукцию на базе поцессоров от Mediatek можно почерпнуть тут

Как именно добавить - зависит от Вашего лончера (которым и обеспечиваются механизмы рабочих столов). А их - сотни. Например, попробуйте длинный тап на раб.стол в свободном месте и посмотрите, что он предложит добавить.
В стоковых лончерах как правило это делается через стандартные виджеты - добавить ссылку (далее - выбор из закладок в системном браузере). Из Chrome и Firefox можно экспортировать на раб.стол. Во многих лончерах можно добавить ярлык с вводом адреса в момент добавления

Если приложение ориентированно на русскоязычную аудиторию, не забудьте про форум 4pda

Гугльмапс (и кажется, Яндек тоже) под андроид умеют перехватывать "свои" ссылки.
А еще, почитайте тут: geouri.org

На вскидку - ghost commander + sftp plugin ?
Что еще нужно, автоматизацию бэкапа?

В Андроид нет однозначного решения этого вопроса.
На разных чипсетах, с разными прошивками - могут работать далеко не все приложения.
Перепробовав в свое время десяток, остановился на этом (https://play.google.com/store/apps/details?id=com.... - у меня на 3х девайсах работает безсбойно (с рутом, андроид 4.0.4 - 5.1.1). Умеет сам отправлять файлы в Dropbox, WebDAV и, кажется, лить на FTP)
Как уже сказали выше, если Вам подойдет другое приложение для записи, которое не умеет отправлять файлы - это можно решить сторонней программой. Я бф использовал для данной задачи не Tasker (зачем усложнять?), а FolderSync https://play.google.com/store/apps/details?id=dk.t...