total commander и сравнение каталогов
в один шуруете все с EXIF - будет большой BIGDIR - вот его копий наделайте
во второй - эталонный, имена есть экзифа нет
срваниваете, оставляете из первого только совпадающие по именам
берете снова копию BIGDIR и подгоняете второй эталонный
ессно копий наделайте чтобы не бояться потерять последний экземпляр
ну или полчаса - час на Питоне