Разобьем задачу на части.
- Перебрать файлы с неверными EXIF.
- Для каждого файла найти соответствующий файл с верным EXIF.
- Перезаписать EXIF.
П. 1, полагаю, реализуется простым for /r
П. 2 можно также реализовать через for /r, но думаю, будет лучше заранее составить список исходных файлов с помощью dir /b /s > list.txt
А поиск выполнять командой find.
Для п. 3 подойдет утилита
ExifTool. Для копирования информации из другого файла предназначен ключ -tagsFromFile