хорошо, если бы Вы пояснили, какие услуги, да еще и на территории РФ, приобретает фрилансер, получающий выплату от Апворка
я прочитал, и ссылку https://habrahabr.ru/post/325992/, что Вы не дали, тоже
там есть желание автора уплатить НДС с некой суммы, но нет ответа на вопрос
то что вы ухватили "НДС с комиссии апворк" не отвечает на вопрос, а просто очерчивает нежелание думать и не быть должным, это вполне понятно
в стремлении легализовать УСН все средства хороши,
прошу прощения что не могу ответить на ваш вопрос