Дмитрий

1. Как все это запихивается под версионный контроль?
так же как и любой другой код.
Кто-то любит composer-lock.json/vendors класть в реп, кто-то нет и тп. С WP так же - можно сам движок класть, можно не класть. Зависит от кодстайла/привычек вашей команды.

2. Где можно посмотреть руководство по эксплуатаци..
На официальном сайте есть документация.
Разработка под WordPress не подразумевает ковыряние разработчика в файлах движка. Вам дали фильтры/хуки, дали несколько api, используйте - этого вполне достаточно. Если нет, скорее всего ваш проект выходит за рамки WP, либо вы делаете что-то не так.

3. Есть ли аналог php the right way...
На официальном сайте. Там же можно найти и правила для phpcs, как настроить юнит тесты и прочее такое

4. Советы от людей, которые как и я пришли разбираться с wp после паттернов проектирования.
А зачем? Вам с чем работать, с этими людьми или с WordPress?
Если вам надо работать, читайте документацию, там все толково расписано. Если же хотите пообсуждать "какой WP фиговый движок" - то это можно ваще на любом форуме в интернете и не обязательно, чтоб собеседники владели какими-либо паттернами.

из коробки WP так не умеет.
я решал так:
1 вешаем хук - при добавлении комментария добавляем/обновляем к родительскому посту метаполе с текущим временем.
2 делаем сортировку по этому метаполю

1 htaccess
2 редирект может закэшироваться в браузере

надо следовать стандартам и не использовать <?=

Пинайте хостера
у вас те страницы, которые долго грузятся, отдаются минуя их кэш с вот такими заголовками
X-Cache: MISS from t1.hoster.ru
X-Cache-Lookup: HIT from t1.hoster.ru:6666

После того, как запинаете хостера, нужно будет решить, сколько кэша и где вам нужно.
Иметь несколько уровней кэширования - плохо. Лучше оставить что-то одно. Проще оставить тот кэш, который вы можете самостоятельно контролировать. В вашем случае это значит отказаться от кэширования на стороне хостера и поставить плагин кэширования для WP.

Еще один очень важный момент.
Этот плагин кэширования (не важно, какой плагин вы будете ставить) нужно будет корректно настроить. Встречал сайты, где плагины были настроены так, что сайт от них торомозил еще больше. Ваша ситуация под такой сценарий как раз и попадает.
Если самостоятельно настроить плагин кэширования не сможете, отказывайтесь от плагина, откатывайтесь к кэшу от хостера. Просите их включить кэш максимально агрессивно.

буквально одной функцией
https://codex.wordpress.org/Function_Reference/wp_...

вот так
https://derekspringer.wordpress.com/2015/05/07/usi...

Можно взять capistrano.
Только WordPress не особо дружит с симлинками, поэтому лучше настроить копирование shared файлов (то, чего нет в репе) при деплое.
Задачу на обновление базы через него так же можно сделать. Можно как самому, так и взять что-то вроде https://github.com/Mixd/wp-deploy

add_filter('jpeg_quality', function($arg){return 100;});

query_posts использовать нельзя

проверьте wp-config.php

если идентичны, добавьте
define('WP_HOME','example.com');
define('WP_SITEURL','example.com');

подробнее и некоторые другие способы, как это можно поправить, тут
https://codex.wordpress.org/Changing_The_Site_URL

https://ru.wordpress.org/plugins/wp-mail-smtp/

>1) На доработку чужого шаблона люди в принципе соглашаются неохотно?
Зависит от качества кода. Бывает, что предыдущий программист (или несколько предыдущих) наворотили такое, что проще взять только верстку и переделать по новой.
Бывают и платные шаблоны в которые внутри очень слабо напоминают WordPress.
Работать с таким кодом не выгодно. Там то, что обычно решается 1-2 строчками кода за 5 минут, может потребовать минимум пары часов.
>2) Получается, что на Freelancehunt.com и Fl.ru тусуется одна школота или специалисты уровня ниже среднего?
А через эти биржи работать сейчас не выгодно.

>4) Тестирование результатов работы тоже отпугивает людей?
Зависит от того, что вы понимаете под тестированием. Вообще, вы лучше прикрепите где-то тут ссылку на ваше ТЗ. Тогда и обсуждение будет более предметным. И будет шанс, что сможете найти исполнителя - некоторые заказы и через этот сайт берут.

Навскидку, что-то вы там не то задумали) Очень редко, когда создание новых кастомных таблиц в базе действительно обосновано.

шаблоны на сайты откуда качали?

Зависит от фреймворка.
Если он не следует стандартам написания WordPress, тащит за собой свой шаблонизатор, дублирует функции движка своими, крайне не советую.

Как пример, сейчас работаю с шаблоном, который использует редкий шаблонизатор latte.
Никакого выигрыша от использования шаблонизатора как сторонний разработчик не вижу:
- свой синтаксис написания кода (да, он простой, но некоторые сложные вещи поправить сходу не интуитивно, нужно тратить время)
- игнорируют стандарты
- устарел (те же srcset оно выдавать не умеет)

Я фреймворки не использую вообще. Да, круто, много всего умеют, но какие-то вещи я и без них могу) какие-то вещи в них не совместимы с инструментами, которые использую, какие-то вещи они делают так, что нужно переделывать.

Genesis и Unyson это не фреймворки, это page builder вроде visual composer'а. Если вы с их помощью планируете создавать тему, то это немного не то.
А если вы уже сделали тему на каком-либо фреймворке или с использованием starter-theme, и у вас теперь вопрос - добавлять совместимость с этими билдерами в тему, то это уже совсем другой вопрос)

Для этого придумали https://wp-cli.org/

добавьте в wp-config.php что-то такое

$url = $_SERVER['HTTP_HOST'];
define('WP_HOME', 'http://'.$url);
define('WP_SITEURL', 'http://'.$url);

и сайт у вас будет работать с двух доменов