Чем заменить Flash или На чем сейчас делают анимацию для веба?

Такую херню сейчас не делают.

Как отправить жалобу на сайт?

Вас не смутил тот факт, что все хвалебные комментарии заминусованы?
s.delphinpro.ru/20170601-204100.png
И ни одного отрицательного. Так не бывает =))

Как задать отступ?

Алексей: я знаю

Почему JavaScript не работает?

Посмотри в консоль и сам ответь на свой вопрос. Ну или задай его потом грамотно.

Как делают страницы без ".html" и без "/" на конце и без использования корневых папок?

Поисковый запрос конечно очень трудно вбить. Как я вас понимаю...
https://www.yandex.ru/yandsearch?&text=как%20сдела...

Что использовать, для создания связей у html блоков?

Но самый очевидный вариант - рисовать svg.
Вашу задачу я бы сначала попробовал реализовать именно так, да и вы вроде так же подумали.

Что использовать, для создания связей у html блоков?

wofh-tools.ru/technology/#sci1
html элементы поверх канвы, линии на канве.
При резайзе окна пересчитываются координаты блоков, и перерисовываются линии.
У вас линии поверх элементов, значит канву располагайте сверху. Будет небольшой геморройчик с кликами по блокам. Но решаемо. Если в лоб - pointer-event для канвы. Но у вас там похоже и ховеры по линиям надо обрабатывать. Так что придется мышку самому обрабатывать. Сложнее, но реально.

Что лучше - много классов и модульный css, или мало классов и wet-css?

Мне ближе первый подход. В нем меньшая связанность кода из-за отсутствия тех самых экстендов. Такой код легче поддерживать.

Что лучше - много классов и модульный css, или мало классов и wet-css?

Это снизит чистоту css-кода

Это неправильная мысль. При использовании препроцессора вам нужно следить за чистотой исходного кода, а не скомпилированного css. Конечно, нужно понимать какие конструкции препроцессора раздувают конечный код и использовать их с умом, но чистота выходного кода не должна быть самоцелью.

Возможно ли с помощью только CSS скрывать/отображать блоки на странице, в зависимости от выбора в выпадающем списке?

Егор Живагин: в принципе полезно заниматься такой херней в свободное время. лучше начинаешь понимать как что работает, учишься нестандартно мыслить, плюс какие-то "изобретенные" техники можно будет в дальнейшем использовать в реальных проектах.

Возможно ли с помощью только CSS скрывать/отображать блоки на странице, в зависимости от выбора в выпадающем списке?

Егор Живагин: Селект можно собрать из тех же радиокнопок. нужно только проявить фантазию =)
Но нах оно нужно...

Откуда на сервере берётся значение для timestamp (например, для функции time() php)?

с часов. откуда же еще? в любом компе есть часы.
современные оси умеют синхронизировать эти часы по службам точного времени в интернете.

Есть ли смысл верстать списками (ul li)?

Список - это список

Возможно ли с помощью только CSS скрывать/отображать блоки на странице, в зависимости от выбора в выпадающем списке?

ну почему сразу "невозможно"?
можно все блоки поместить в один поток и абсолютом спозиционировать.

тут нужно уточнение - в реальных проектах невозможно =)
а поиграться для прокачки скиллов - пожалуйста.

Как правильнее сверстать блок с картинкой растянутой по всей ширине и высоте?

Александр Андреев: Делайте бекграундом.
Если позволяет ТЗ - можете запилить тегом img со свойством object-fit

Как правильнее сверстать блок с картинкой растянутой по всей ширине и высоте?

Александр Андреев: ну так чем он аргументировал-то?

Как правильнее сверстать блок с картинкой растянутой по всей ширине и высоте?

как-то не очень красиво если для каждого элемента списка акций в HTML будут прописаны стили style="background-image: ...."

Почему? Какие аргументы?

Можно ли восстановить файлы удаленные Gulp?

https://www.yandex.ru/yandsearch?text=Как%20восста...

Как заставить работать блок реагировать на клик блок вставленный кодом JQuery?

Либо навешивать событие на каждый добавленный узел,
либо слушать всплывающие события на постоянно присутствующем родителе (делегирование событий)

Второе:

<div class="parent">
  <a href="#">Dynamically added link</a>
</div>

$('.parent').on('click', 'a', function(){
  alert('Cliked!');
});

Как решить конфликт Sass/sourcemapce в git?

Andrew Chil: Система деплоя это то, что будет собирать и заливать ваш код на боевой сервер.
Это может быть

1. Специализированный программный комплекс (jenkins, capictrano и т.д.). Годится для серьезных больших долгоиграющих проектов
   
2. Небольшой скрипт, запускаемый по гит-хуку, который тащит свежие сорцы из репы, запускает gulp-задачи на сборку и заливает билд на сервер
   
3. Специально натасканный HomoSapiens =) Который все делает вручную - собирает, заливает по (s)ftp