В данном случае достаочно держать только парента у коментария, а потом спрашивать есть-ли коментарии с таким парентом
или
Сделать примерно вот так:
автонкремент на ид = 100, тй. 100, 200, 300, итд…
таблица:
ид, левел, коментарий
100, 1, «коментарий 1»
ответы на коментарий вставлять в таблицу с +1 на ид.
101, 2, «коментарий на коментарий 1»