Так в контроллере делается firstOrFail() почему этим не пользуетесь? И что стоит дописывать к модели в контроллере ->firstOrFail()

Вот что я сделал и все заработало потратив несколько часов на прочтение документации.

sudo -i
cd /var/lib/mysql/

Далее смотрим что в директории:
sudo -i
ls -a

И удаляем:

sudo rm /var/lib/mysql/ib_logfile0
sudo rm /var/lib/mysql/ib_logfile1

В конце перегружаем vagrant
vagrant reload --provision
Удалось восстановить все без потерь.

preg_match('/^[a-z_]+$/i', $input_line, $output_array);

Вам видимо нужно использовать класс RecursiveDirectoryIterator
Он предоставляет интерфейс для рекурсивного перебора каталогов файловой системы.
Подробно:
php.net/manual/ru/class.recursivedirectoryiterator.php

https://lodash.com/docs/4.16.4#difference

_.difference([2, 1], [2, 3]);
// => [1]