.item {
display: -webkit-box;
display: -webkit-flex;
display: -ms-flexbox;
display: flex;
-webkit-align-items: center;
-webkit-box-align: center;
-ms-flex-align: center;
align-items: center;
-webkit-box-pack: justify;
-webkit-justify-content: space-between;
-ms-flex-pack: justify;
justify-content: space-between;
padding: 0 15px 0 0;
font-size: 16px;
color: #3c3e44;
position: relative;
-webkit-transition: color .4s ease;
transition: color .4s ease;
height: 75px;
border-right: solid 1px #dddede;
border-bottom: solid 1px #dddede;
-webkit-transition: box-shadow .4s ease-out, color .4s ease;
transition: box-shadow .4s ease-out, color .4s ease;
/* убрать у .item ширину и добавить флекс */
flex: 0 0 33.33333%;
box-sizing: border-box;
}
Если нужны мучения и/или логотип строго посередине экрана, то можно либо кнопке добавить position: absolute, либо header__body — паддинг слева той же ширины, что и кнопка )