В 3д редакторе создается модель и анимируется, потом нарезается покадрово, получается набор изображений типа
такого. Потом к скролу страницы привязывается функция, которая переключает отдельные картинки. В простом случает это просто img где меняется src, в сложном это canvas с предзагрузкой. Много готовых плагинов,
например.
Для коротких анимаций можно объединить кадры в спрайт и переключать положение, например
плагином