В самсунгах режим "зарядка до 80%" встроен в BIOS, т.е. на аппаратном уровне. Battery Life Extender только активирует эту функцию из винды. Больше такой фишки я ни у кого не видел. У меня нетбук Самсунг. Подтверждаю продолжительную работу от аккумуляторов (4-5 часов кино) в режиме "Экономия энергии" на минимальной яркости экрана с отключенным тачпадом и безпроводными модулями, после 3-х лет каждодневной эксплуатации.
Вообще, хранить NiMH рекомендуется с 50% заряда, т.е. не полностью заряженными.
Аккумуляторы также деградируют при высоком нагреве. При почти полной зарядке, не смотря на то, что "умные" зарядные устройства уменьшают ток зарядки, они сильно нагреваются. Чтобы этого избежать и увеличить срок службы при ПОСТОЯННОМ подключении к сети, Самсунг реализовал такой режим.

Можно. ВТ-маломощные устройства в разрешенном диапазоне.

Лучше не останавливать, т.к. в неподходящий момент, когда будет необходимо удаление излишнего тепла из БП, могут случиться неприятности, из которых самая безобидная - выход из строя БП.
Шум от работы вентилятора прямопропорционален количеству оборотов. Самый разумный выход - поставить автоматический реобас, в котором вентилятор без нагрузки/на минимальной нагрузке на БП буден неподвижен, а при появлении нагрузки начнет снимать тепло с элементов минимальными оборотами, увеличивая их при необходимости.

Потребление такой atmega328 будет в районе 15-20 mA.