Арсен

Удалятся ли локальные копии файлов в этой папке, если они будут удалены из облака

Разумеется.

Можно ли это предотвратить

Очень просто - запретить синхронизацию.

или каким-то образом восстановить файлы?

Зависит от того как удалили, если в корзину, то можно восстановить из корзины.

Какое облако лучше всего использовать в связи с этим?

Сервисов много, выбирайте.
Посоветовать невозможно, потому что вы не сообщили критерии для выбора.

ПКМ по адресной строке -> Edit search engines -> исправьте запрос для багнутого поисковика.