Если Вы имеете ввиду откат в исходное состояние, то при такой операции Windows удаляет все драйвера для подключенных позднее устройств.
1. Если клавиатура и манипулятор USB возможно нужно просто подождать пока ОС их иннициализирует и установит драйвера, после чего они начнут работать
2. Проверить настройки BIOS, возможно отключена поддержка USB-клавиатуры и мыши
3. Сталкивался с ситуацией, когда необходимо использовать PS/2 в начале, а потом после полной загрузки ОС USB уже подтягиваются нормально.
Мне кажется в Вас вариант три.