Была похожая история ночью во время бекапов с Proxmox падали все интерфейсы на микротике и сразу подымались.
Помогло отключение hardware offload на всех интерфейсах. Несколько проиграл в максимальной скорости сети и нагрузке на CPU, но это было для меня менее критично чем нестабильная сеть.
