Круг сделать псевдоэлементом и применять анимацию к нему. У вас ведь в LI есть дочерние элементы, поэтому все и крутится. https://codepen.io/anon/pen/mKRrqb
Фотошоп? В слоях выдели нужный слой, зажми Command (на Mac), Ctrl или Alt (в Windows, точно клавишу не помню)
С зажатой клавишей наведи на холсте на нужный слой.
В результате увидишь следующее:
1. нет, это физически невозможно, если сравнивать рендеринг в редакторе и браузере, это разные вещи.
2. хз
3. не нормально
В PP допускаются погрешности, но и сам макет должен быть идеальным, что само по себе редкость.
И в основном PP проверяется на десктопах и то не всегда, делать его под все разрешения е....ся