Этот точно не из-за некорректно закрытой сессии. Телеграм бот просто конектится по HTTP или ждет запросов по HTTP , у вас видимо нет каких то проверок в update, поставьте брейкпоинт и посмотрите что приходит . Напишите обрабоичик исключения.
vebmaster, какой id у пользователя pain?какой id у пользователя proftpd?
какой именно пользователь создал каталог?
какой пользователь переименовывает?
покажите список каталогов с правами