Как можно реализовать управление удаленным сервером без использования RDP?

На серверных есть 2 бесплатных подключений. Бывает платные подключения уже все израсходованы, ибо они определены в лицензии. Тогда вводим ключик /console или /admin (в зависимости от версии) и подключаемся сверх лицензии. Но только 2 максимум.

Как можно реализовать управление удаленным сервером без использования RDP?

Зависит от оси. На десктопных (без кряков и хаков) - второй подключившийся пользователь отрубает первого.