Не вижу ничего плохого в подключении jQuery через cdn (Яндекса или Гугла) - для пользователя остается незамеченным ибо кешируется, т.к. используется чуть менее чем на всех сайтах. А т.к. веб проекты как правило имеют свойство меняться - придется что-то доделать - а у вас только ваши функции.