Да, так и должно быть.
Это бич Линукса на десктопе и одна из тысячи причин, почему он никогда не будет распространён более, чем на 0,2%, как сейчас.
Проблема известная и проявляется на всех версиях ядра, можете ещё попробовать во время этого какой-нибудь файл скопировать, система вообще колом встанет.
Решения нет и не предвидится.