davecolland, следует попытаться определить, в каком состоянии все было до попытки мерджить и вернуться к нему.
Какие команды были выполнены?
Что сейчас показываетgit status ?
Заблокируйте доступ руту по ssh во избежании подобной ситуации впредь.
Если за собой не прибрались - у рута мог сохраниться history выполненных команд.
Как вы эксплуатируете sssd? Самый вероятный сценарий для злоумышленника на мой взгляд - завести учетную запись с повышенными привилегиями. Конкретнее расскажут логи (которые вы не приложили). Правда при недостаточном уровне логирования информации может оказаться недостаточно. Следует проверить базу пользователей на предмет появления новых или незнакомых за этот период времени.
У Orthanc достаточно большая и подробная документация, в том числе и подключение Postgresql через плагин там описывается https://book.orthanc-server.com/index.html
А dcm4che это не готовый продукт, а набор библиотек и разрозненных утилит
А так-то да, получается такой функционал отсутствует. Есть расширение, добавляющее больше функций, но не уверен что и оно поможет https://addons.thunderbird.net/ru/thunderbird/addo...