X-NoNAME

Если вы хотите, что бы сайт открывался по адресу:
websitename/index.php
То:
1. нужно в hosts добавить 127.0.0.1 websitename
2. Перенести ( или перенастроить конфиг) Файлы в /var/www/html/ , что бы было /var/www/html/index.php

Может из-за этого?

for(File dirs : listDirectories){
       listDirectories.add(i);
 }

На правильность не претендую, но я бы сделал так:

Set<File> copyListDirectories = new HashSet<>(listDirectories);
 for(File dirs : copyListDirectories ){
       listDirectories.add(i);
 }

Если речь о git-репозитории.
20 последних комитов из ветки develop с возрастающей датой можно получить так:
git log -20 --branches=develop --date-order --reverse --format=format:%H

потом в цикле для каждого коммита запускаешь задачу на тестирование.

Подробнее тут: git-scm.com/docs/git-log

Также можно отредактировать файлик hosts
-windows: C:\Windows\System32\drivers\etc\hosts
-linux: /etc/hosts

Добавить такую запись:
127.0.0.1 mydomain.com

и ваш локальный сайт будет доступен по адресу http://mydomain.com