я использую сеть хостовой машины, на нджинксе прописан апстрим, к примеру на 127.0.0.1:9000, контейнер запущен с параметром net=host, и, соответственно, пхпфпм слушает такие же порты и его контейнер запущен так же
Starting Nmap 6.47 ( nmap.org ) at 2015-03-06 15:57 RTZ 2 (зима)
Nmap scan report for XXX.XXX.XXX.XXX
Host is up (0.027s latency).
All 1000 scanned ports on XXX.XXX.XXX.XXX are open|filtered
Nmap done: 1 IP address (1 host up) scanned in 29.44 seconds
Для движка иннодб рекомендуется использовать параметр --single-transaction. Я вообще делаю очень быстро и очень просто: использую ключ --single-transaction и ключ --master-data, при этом не нужно блокировать таблицы на мастере. в вашем случае, скорее всего при блокировке вы не сбрасывает таблицы на диск (flush tables). По указанным мной параметрам создается дамп базы. в самом ее начале будет позиция и имя бинлога. перед созданием слейва, рекомендую снести там старую базу, выполнить stop slave; reset slave; и только потом заливать дамп, выполнять change master и start slave;
PS если нет веских причин - рекомендую обновить до 5,6
