Как из компании запустить бизнес процесс в сделках?

Рундук, тогда сделайте запуск не при создании, а при изменении. Чтобы БП сработал, можно массово изменить какое-либо поле в сделках (или создать новое для этой операции).
Да, вариант костыльный, но по новым сделкам уже такой фокус проделывать не надо будет.