VoidVolker

Серверная часть приложения размещается в отдельном каталоге с ограниченными правами, а не в каталоге статических файлов, которые отдаются веб-сервером. Традиционно для бэкенда на сервере создаётся отдельный пользователь, от имени которого запускается NodeJS как сервис, а в его домашнем каталоге или в другом каталоге с ограниченными правами и размещается код бэкенда. Второй случай используется, когда доступ к данному каталогу нужен другим приложениям/сервисам. Например системе доставки и развёртывания.

proxy_pass https://localhost:3000;

Обратите внимание на протокол. Какой у вас протокол в вашем веб-сервере на ноде? А какой протокол в инструкции указан? Рекомендую детально и тщательно изучить что такое веб-сервер, как он работает, какие протоколы бывают, зачем они нужны и прочее из той же области.

1. Выкидываете из основного конфига /etc/nginx/conf.d все ваши настройки текущего сайта
   
2. Пишите отдельно конфиг каждого сайта в файлы вида /etc/nginx/sites-available/site.domain
   
3. В конфигурацию сервера добавляете домен сайта: server_name site.domain;
   
4. Добавляете симлинки для каждого сайта в каталог sites-enabled: /etc/nginx/sites-available/site.domain -> /etc/nginx/sites-enabled/site.domain
   

RTFM: там в мануале есть подробная инструкция и даже с картинками: https://kb.porkbun.com/article/54-pointing-your-do... И аналогичный мануал есть у каждого регистратора доменов и у каждого хостера по всему интернету.

Кроме IP адреса машины, вам еще нужен порт по которому вы подключаетесь. Ставите сетевые утилиты для вашей ОС и смотрите на каком именно IP адресе и порту запущен веб-сервер, если вообще запущен.
Веб-сервер запущен должен быть либо на IP 0.0.0.0 - что значит все сетевые адаптеры, либо на IP конкретного сетевого адаптера, который подключён в виртуалбоксе. А вот если он запущен на IP адресе 127.0.0.1 - это значит, что снаружи он недоступен и надо указать верный адрес.
Так же в фаерволле должны быть открыты все требуемые порты для вашего сервиса и веб-сервера, если он установлен.

Первое, что приходит в голову - это ошибка в длине записываемой строки где-то, т.к. ноль обычно используется как символ конца строки. Причины могут быть разные: массив с нулями, который не очень правильно конвертируется в строку, ошибка в кодировке и/или конвертации строки из одно/двух байтовой, какой-то пустой буфер, неправильный режим записи в файл - текст/бинарные данные, например. Надо делать подробный дамп каждой записи в файл и смотреть, где и что именно пишет не то, что ожидается.

VPN. Хецнер банит наших - так что будьте готовы, что в любой момент они и аккаунт заблочат.

Гугл -> nginx reverse proxy
Примерный конфиг:

server {
    listen 80;
    server_name sitename.ru;

    location /nextcloud {
        proxy_pass http://127.0.0.1:8080;
        proxy_buffering off;
        proxy_set_header X-Real-IP $remote_addr;
        proxy_set_header X-Forwarded-Host $host;
        proxy_set_header X-Forwarded-Port $server_port;
        proxy_set_header X-Forwarded-For $proxy_add_x_forwarded_for;
    }
}

Плюс возможно в nextcloud что-то дополнительно в конфиге надо настроить (не юзал, точно не скажу).

Вот еще один отличный ресурс по HTML: https://htmlbook.ru/

Используйте NGINX, не ошибетесь.