Использовать флешку вам никто не запрещает. Но у флешки тоже ограниченный ресурс, разве что она дешевле. В целом для таких устройств есть специальная файловая система f2fs, которая оптимизирует работу с накопителями и продлевает их "жизнь".
Я советую вам, поставить максимально возможное количество оперативной памяти, использовать облака для часто изменяемых файлов и отключить swap-раздел.
Будет ли идти запись сразу на флешку или нет - вопрос к программному обеспечению, но скорее всего будет писаться сразу.