Вероятно есть готовые методологии, о которых мы просто не знаем. В условиях отсутствия отработанной методы, полагаю, следует постараться разобраться в том, кто какой вклад вносит в развитие компании.

При оценке можно оперировать несколькими параметрами. Например следующие:

• участие в разработке концепции
• финансовое участие
• доля финансового участия
• готовность работать без оклада
• уровень "незаменимости"
• участие в увеличении прибыли компании (т.е. собственно продажи)
• ..

Попробуйте назначить виртуальные баллы за каждую "ачивку". Общая сумма всех баллов будет составлять 100%, которые после можно разбить на доли соответствующие количеству кофаундеров.

При таком подходе, я думаю, можно отделить "сотрудников" от "владельцев".
Если, скажем, дизайнер готов поработать бесплатно на этапе запуска, а потом рубить годами бабло за единоразово выполненный проект, то логичней договориться с ним за ставку.