Обратил бы еще внимание на XYplorer - это файловый менеджер, в котором есть функционал тэгирования файлов. Познакомился с ним только вчера, первые впечатления очень позитивные.
Еще идея. Создать пул папок, названия которых будут тэгами. Потом пройтись по файловой системе с физическими файлами и на нужные файлы понасоздавать ссылки и эти ссылки переместить в нужные тэгированные папки.