Steppp

Перед первым "уведомление о куки" проверяй куки, если там запись, типа "сookie: true;"
Если такой записи нет, то показывай окно уведомлений, и записывай в куки "сookie: true;".
Перед последующими "уведомление о куки" проверяй куки, если есть "сookie: true;" то не показывай "уведомление о куки"

2. Почему-чо не работает checkbox - Так он сделан не до конца! Как по вашему он должен додуматься в право сдвинутся? Магия)

Зачем смешиваешь jquery с нативным js?
Текст изменится в теге с id pm-counter-s, после клика по меню (main-menu)!

$('#main-menu').click(
      function () {		
        $("#pm-counter-s").html("Новый текст");
      }
  );

let str = '2020-09-30'
let res = str.replaceAll('-', '.');
console.log(res);

Тут почитатй КЛАЦ )))

А скобки правильно закрываешь? На сколько я знаю надо закрывать скобку перед navigation, в саму навигацию скрывать через css

let saySlider = new Swiper(".say__slider", {
  effect: "fade",
  autoplay: {
    delay: 3000,
    disableOnInteraction: false,
  },
 navigation: false,
  breakpoints: {
     600: {
     slidesPerView: 1,
      slidesPerGroup: 1,
      initialSlide: 1,
      spaceBetween: 35,
      centeredSlides: true,
      speed: 800,
    effect: "slide",
},   //  <-------
},   //  <-------
      navigation: {
        nextEl: ".swiper-button-next",
        prevEl: ".swiper-button-prev",

    },



});

сделай addEventListener('resize', и обнови enquire.register

Чтоб обновить, засунь их в функцию, и запускай функцию при старте и при ресайзе)
По идеи должно помочь)

При переключении, у тебя каждый раз вешается обработчик клика!
Тоесть каждый раз когда ты переключаешь чекбокс, у тебя скапливаются эти обработчики, и сколько обработчиков, на столько и добавляется! Каждый обработчик дает +1

Выход из ситуации: Удалять обработчик, или вынести его за функцию jQuery('#checkbox_more_page').change(function() {
Лучше вынести, все ровно код работает криво! А если Add more pages не чекнут, просто блокировать + -

let iframe = document.querySelector(`iframe`);
function button1() {
iframe .src = 'http// ... ... ...'
}
function button2() {
iframe .src = 'http// ... ... ...'
}

самый простой способ filter: invert(<значение>);
Ну а вообще тут много примеров

<br/>

Попробуй так

function reTransform(item,addClass){
let class = addClass;
item.classList.add(class) 
}
reTransform(item, 'className' )