1. Как вы планируете сохранять это состояние при обновлении ядра? Появится новая директория со всеми стандартными модулями.
2. Вручную бы установил минимальную конфигурацию-а затем вручную же выгрузив список пакетов через rpm -qa например - проанализировал их и удаляя ненужные на мой взгляд пакеты с сохранением зависимостей - составил бы их список.
Но есть несколько проблем:
1. От версии к версии список зависимостей меняется- и удаление пакетов по списку может привести к тому-что удалится по зависимостям что-то необходимое для работы.
2. Вариант с жесткой минимизацией приведет к невозможности поддержки системы, установки обновлений, дополнительных пакетов и т.п.