Не пользуюсь поделкой по имени Brackets (потенциал, безусловно, есть, но пока это не более чем поделка) , и тем более SCSS плагинами к редакторам, но отступы, уверен, можно поправить в конфигах этих плагинов. Ручной запуск через консоль - вообще прошлый век.
Если хотите удобства, используйте для компиляции Gulp.